细胞系开发的样本数据要求:
整理来自不同的分析仪器的数据和处理不同文件格式
在不同的孔板和孔之间跟踪
数据能长时间保存和快速查找调用
使用Biomek工作站CLD整合系统配合三大软件(Biomek,SAMI 和DART)帮您轻松完成数据处理。
细胞株开发现面临巨大工作量的数据挑战。与任何筛选过程一样,样本通量带来了数据量的挑战。当使用多种分析工具以不同格式生成不同类型的数据时,这就变得更加具有挑战性。而且现在很多筛选要求多个方面的综合结果来确定Hit Picking,因此其工作流要求必须使用这些hits的数据追踪。在整个过程中,必须对数据进行追踪,以确保进入生产的任何细胞株都有必要的历史数据(例如单克隆性的证明),并且为了报告需要,所有的数据需要随时快速被找到。
解决容易出错的数据格式问题
在Microsoft Excel中复制和调整数据也是上是一个容易出错的过程 ,特别是当试图关联来自不同分析器的数据时。例如, 我们使用CloneSelect Imager来对细胞单克隆性和生长测定,按行显示报告结果(A1, A2, A3…图1)。相反,我们使Octet HTX对IgG按列进行滴度测定(A1, B1, C1,…,图1)。如果有人试图在Microsoft excel中按名称重新排序八位数据,则井仍然与CloneSelect数据不一致(A1, A10, A11…,图1)。而自动化软件能很快处理该问题,完成统一数据格式调整和编辑。
图1:数据关联示意图
DART数据库能储存和自动检索数据
图2:自动化数据处理示意图。
自动关联样本数据
图3:自动化数据处理示意图
在细胞株开发的整个过程中,这些步骤都是重复的,这些步骤包括将检测数据与样品孔连接,将来自多个分析仪的数据关联起来,使用数据来驱动数据采集,并将所有数据提前以供追溯。此外,储存所有潜在细胞株的数据是必要的,因为很多细胞株在后期会由于基因组不稳定或其他不需要的属性而退出,而且不可能知道z终会选择哪些细胞株用于细胞株库。
快速浏览和数据可视化
为自动运行存储和利用数据只是问题的一部分。您还必须能够在需要时轻松地访问数据,DART数据库可以通过多种方便的方式访问。为了以用户友好的方式进行快速可视化,DART数据浏览器(图4A)可以在Chrome浏览器中突出显示方法、耗材和孔层面的数据。不仅可以远程查看这些数据,还可以在运行期间刷新这些数据以使用实时数据进行更新。为了以可用的形式导出数据,可以使用DART报告生成器在Excel中生成报告,使用一个简单的界面来选择要包含在给定报告中的数据。所有这些都可以在不借助IT资源的情况下完成——这是一些大型数据管理系统的常见需求。